Windows Eliminar archivos duplicados

Holitas.

Tengo una duda respecto a los archivos duplicados que encuentra CCleaner y he pensado que antes de aventurarme y liarla sería propicio preguntar en foro informáticos.

Me salen un porrón de archivos .dll duplicados. No sé qué he hecho mal porque suelo ser muy cuidadoso, pero los hay. El caso - la mayoría de ellos están todos en la carpeta de Program Files o incluso en la misma carpeta de Windows. He aquí mi duda pues: ¿es peligroso borrar algo que está alojado en esas carpetas? Me da miedo tirarme aquí una hora seleccionando archivos para que después se me joda el pc y tenga que restaurarlo. Cabe añadir, por si queda alguna duda, que sé poco o nada de informática.

Aún voy bien de espacio en el disco duro pero me gusta tener el C: lo más despejado posible (instalo todo en D: ).

Les dejo mis dieses y grasias de antebraso.

Lo de instalar en D: si no está en otro disco no tiene mucho sentido, no tiene beneficios.

En windows cada programa que instalas crea sus propias dll's, no se usa una librería común para todos (como en linux) con lo que si borras las dlls puede pasar que algún programa deje de funcionar.